La ville de Bonnencontre se situe dans le département Côte-d'Or.
Les villes à proximité sont les suivantes : Pagny-la-Ville, Lechâtelet, Charrey-sur-Saône, Saint-Nicolas-lès-Cîteaux, Esbarres, Broin.
1 infirmier et infirmière à domicile pratique à Bonnencontre.