L'agglomération de Moissey est située dans le département Jura.
Les communes limitrophes sont les suivantes : Montmirey-le-Château, Montmirey-la-Ville, Amange, Offlanges, Archelange, Châtenois, Gredisans, Frasne-les-Meulières, Menotey.
10 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Moissey.