La municipalité de Montmorot se situe dans le département Jura.
Les municipalités alentours sont les suivantes : Villeneuve-sous-Pymont, Lons-le-Saunier, L'Étoile, Ruffey-sur-Seille, Saint-Didier, Larnaud, Courlans, Messia-sur-Sorne, Courbouzon.
7 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Montmorot.