L'agglomération de Courgenay se situe dans le département Yonne.
Les agglomérations limitrophes sont les suivantes : Bercenay-le-Hayer, Bagneaux, Pouy-sur-Vannes, Planty, Lailly, Bourdenay, Saint-Maurice-aux-Riches-Hommes, Villeneuve-l'Archevêque, Molinons.
3 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Courgenay.