La municipalité de Auxonne se situe dans le département Côte-d'Or.
Les agglomérations alentours sont les suivantes : Les Maillys, Villers-les-Pots, Athée, Tillenay, Labergement-lès-Auxonne, Poncey-lès-Athée, Flammerans, Billey, Villers-Rotin, Biarne, Chevigny, Rainans, Peintre.
42 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Auxonne.