La commune de Bon-Encontre se situe dans le département Lot-et-Garonne.
Les municipalités à proximité sont les suivantes : Castelculier, Sauvagnas, Agen, Boé, Pont-du-Casse, Saint-Caprais-de-Lerm.
16 infirmiers et infirmières à domicile pratiquent à Bon-Encontre.