La municipalité de Bonningues-lès-Calais est située dans le département Pas-de-Calais.
Les agglomérations limitrophes sont les suivantes : Coquelles, Escalles, Fréthun, Hervelinghen, Nielles-lès-Calais, Peuplingues, Pihen-lès-Guînes, Saint-Inglevert, Saint-Tricat.
1 infirmier et infirmière à domicile exerce à Bonningues-lès-Calais.