La municipalité de Fontaine est située dans le département Territoire de Belfort.
Les agglomérations alentours sont les suivantes : Foussemagne, Chavannes-sur-l'Étang, Frais, Lacollonge, Larivière, Phaffans, Reppe, Vauthiermont.
3 infirmiers et infirmières à domicile pratiquent à Fontaine.