L'agglomération de Saint-Nicolas-lès-Cîteaux se situe dans le département Côte-d'Or.
Les villes alentours sont les suivantes : Boncourt-le-Bois, Aubigny-en-Plaine, Bessey-lès-Cîteaux, Bonnencontre, Broin, Charrey-sur-Saône, Corcelles-lès-Cîteaux, Épernay-sous-Gevrey, Gerland, Izeure, Magny-lès-Aubigny, Savouges, Villebichot.
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