La commune de Cloyes-les-Trois-Rivières se situe dans le département Eure-et-Loir.
Les municipalités alentours sont les suivantes : Beauce la Romaine, Ouzouer-le-Doyen, Brévainville, Saint-Jean-Froidmentel, Villebout, Commune nouvelle d'Arrou, Ruan-sur-Egvonne, Saint-Denis-les-Ponts, La Chapelle-du-Noyer, Thiville, Villemaury.
14 infirmiers et infirmières à domicile pratiquent à Cloyes-les-Trois-Rivières.