La municipalité de Saint-Lys est située dans le département Haute-Garonne.
Les municipalités alentours sont les suivantes : Seysses, Fonsorbes, Lamasquère, Fontenilles, Saint-Clar-de-Rivière, Saiguède, Sainte-Foy-de-Peyrolières.
59 infirmiers et infirmières à domicile pratiquent à Saint-Lys.