La municipalité de Saint-Jean-le-Comtal est située dans le département Gers.
Les agglomérations alentours sont les suivantes : Barran, Lamazère, Miramont-d'Astarac, L'Isle-de-Noé, Lasséran, Labéjan, Durban, Lasseube-Propre.
3 infirmiers et infirmières à domicile pratiquent à Saint-Jean-le-Comtal.