L'agglomération de Saint-Aubin se situe dans le département Jura.
Les agglomérations alentours sont les suivantes : Franxault, Montagny-lès-Seurre, Abergement-la-Ronce, Aumur, Tavaux, Tichey, Champdivers, Peseux, Saint-Loup.
5 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Saint-Aubin.