L'agglomération de Saint-Aubin se situe dans le département Jura.
Les agglomérations alentours sont les suivantes : Peseux, Saint-Loup, Tichey, Champdivers, Montagny-lès-Seurre, Franxault, Aumur, Abergement-la-Ronce, Tavaux.
5 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Saint-Aubin.