La ville de Villers-Farlay est située dans le département Jura.
Les agglomérations alentours sont les suivantes : Arc-et-Senans, Chissey-sur-Loue, Cramans, Écleux, Mouchard, Villeneuve-d'Aval.
3 infirmiers et infirmières à domicile travaillent à Villers-Farlay.