L'agglomération de Saint-Germain est située dans le département Haute-Saône.
Les municipalités alentours sont les suivantes : Montessaux, Mélisey, Lantenot, Froideterre, La Neuvelle-lès-Lure, Franchevelle, Lure, Linexert.
3 infirmiers et infirmières à domicile pratiquent à Saint-Germain.